20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2428 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  44.53 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  42.38 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  43.88 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  42.68 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  38.32 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  40.89 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  40.93 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  34.38 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  34.72 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  37.93 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  32.19 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  33.73 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  27.6 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  25.54 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  25.54 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  27.51 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  27.35 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  28.21 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>