41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1264 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  62.76 
 
 
160 aa  168  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  44.57 
 
 
195 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  52.48 
 
 
192 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  53.19 
 
 
169 aa  137  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  47.95 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  44.38 
 
 
216 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  39.62 
 
 
257 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  43.92 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  42.95 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  42.03 
 
 
328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  47.45 
 
 
170 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  42.22 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  46.21 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  40.36 
 
 
175 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  40.36 
 
 
175 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  40.36 
 
 
175 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  47.1 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  36.65 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  44.37 
 
 
185 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  40.36 
 
 
175 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  44.78 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  44.93 
 
 
179 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  44.68 
 
 
154 aa  104  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  38.67 
 
 
295 aa  104  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  46.21 
 
 
267 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  42.25 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  34.75 
 
 
340 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  40.56 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  42.22 
 
 
173 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  39.1 
 
 
226 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  40.91 
 
 
172 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  47.26 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  37.95 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  40.74 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  33.8 
 
 
257 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.11 
 
 
255 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  24.74 
 
 
255 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>