17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0718 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1173    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  50.17 
 
 
580 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  45.44 
 
 
579 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  34.56 
 
 
587 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  32.19 
 
 
573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  32.02 
 
 
573 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  25.57 
 
 
613 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0120  hypothetical protein  23.55 
 
 
598 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1730  hypothetical protein  25.66 
 
 
509 aa  94.7  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4575  hypothetical protein  21.03 
 
 
591 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000245831  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0137  hypothetical protein  23.43 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  23.31 
 
 
596 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  24.13 
 
 
575 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0073  hypothetical protein  21.57 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0790  hypothetical protein  21.8 
 
 
572 aa  65.9  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.899701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4364  hypothetical protein  23.01 
 
 
570 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  20.1 
 
 
551 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>