46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0325 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  306  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  63.01 
 
 
147 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  45.32 
 
 
224 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  44.22 
 
 
154 aa  128  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  44.2 
 
 
159 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  43.48 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  42.18 
 
 
162 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  36.89 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  31.97 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  32.19 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.39 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  32.48 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  34.93 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  32.03 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  31.85 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  31.41 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  32 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  30.77 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  30.77 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  32.23 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  32.23 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  32.23 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  35.45 
 
 
212 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  28.87 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  30.4 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  31.29 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1594  N-6 Adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
206 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  29.08 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  35.9 
 
 
194 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  26.95 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  31.48 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0964  bacterio-opsin linked product  30.77 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  30.71 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  26.17 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0967  bacterio-opsin linked product  30.77 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  29.2 
 
 
145 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>