21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3665 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3665  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  82.61 
 
 
451 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  63.64 
 
 
446 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  59.09 
 
 
449 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  66.67 
 
 
443 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  66.67 
 
 
443 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  60.47 
 
 
446 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.14 
 
 
463 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  54.76 
 
 
454 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.49 
 
 
459 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  59.52 
 
 
468 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  59.52 
 
 
469 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  59.52 
 
 
468 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  54.76 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  55 
 
 
468 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  43.18 
 
 
452 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.62 
 
 
450 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  47.62 
 
 
450 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  41.86 
 
 
459 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  43.18 
 
 
449 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  40 
 
 
469 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>