23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2582 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1239    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5048  hypothetical protein  36.3 
 
 
570 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.237947  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  41.5 
 
 
552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  40.41 
 
 
546 aa  240  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  39.65 
 
 
624 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  37.54 
 
 
693 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  28.91 
 
 
400 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  53.97 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  53.97 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  43.08 
 
 
585 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  40.62 
 
 
389 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
674 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  26.1 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3317  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1641  hypothetical protein  34 
 
 
166 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.664673 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.74 
 
 
416 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.74 
 
 
416 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.74 
 
 
416 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.74 
 
 
400 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  24.76 
 
 
707 aa  47.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  30.33 
 
 
523 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  31.4 
 
 
1200 aa  43.5  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  23.46 
 
 
1318 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>