20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0548 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  809    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  29.22 
 
 
693 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  28.46 
 
 
546 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  26.92 
 
 
552 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  29.07 
 
 
624 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5048  hypothetical protein  27.27 
 
 
570 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.237947  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  27.33 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  29.05 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.81 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  27.43 
 
 
454 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  29.8 
 
 
570 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.71 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.71 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.71 
 
 
416 aa  46.6  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.71 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.14 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.48 
 
 
1025 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  30.06 
 
 
833 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  27.94 
 
 
667 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
674 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>