38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2121 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  71.31 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  71.72 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  72.13 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  60.82 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  51.43 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  51.02 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  51.02 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  50.61 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  50.2 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  51.84 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  50.81 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  50.61 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  46.12 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  46.12 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  31.98 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  26.82 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.05 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  26.13 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  30.27 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  25.4 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  23.26 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  28.45 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  30.91 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  27.85 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  29.52 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  30.85 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  25.7 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  32.97 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  25.59 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  28.14 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  26.2 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2273  proteasome-type protease-like protein  35.64 
 
 		 352 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0927551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  29.73 
 
 		 226 aa  42  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>