15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0317 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0317  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  745    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1755  GCN5-related N-acetyltransferase  61.21 
 
 
693 aa  461  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000187342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2091  hypothetical protein  59.47 
 
 
348 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.280136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1336  hypothetical protein  55.14 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0456128  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1510  hypothetical protein  48.72 
 
 
387 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183129  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0733  hypothetical protein  47.8 
 
 
496 aa  347  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5205  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 
361 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000197497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 
780 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
1073 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3554  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
340 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0903  hypothetical protein  36.2 
 
 
357 aa  212  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1084  hypothetical protein  34.42 
 
 
390 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.656403  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0188  hypothetical protein  33.62 
 
 
363 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0797  hypothetical protein  30.96 
 
 
421 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.853648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3324  hypothetical protein  37.24 
 
 
409 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>