26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2347 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.26 
 
 		 248 aa  332  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  67.84 
 
 		 254 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  68.27 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  68.53 
 
 		 260 aa  325  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  47.29 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.35 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.72 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  45.08 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  45.87 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  46.22 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  45.2 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  45.85 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  45.85 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 734 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  31.4 
 
 		 730 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  31.02 
 
 		 745 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.16 
 
 		 732 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 733 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 728 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  32.62 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  31.01 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3270  methionine synthase  30.56 
 
 		 924 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  31.69 
 
 		 146 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>