13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1786 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  31.09 
 
 		 319 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  24.14 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  25.48 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>