21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0469 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  921    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0468  methylation site  29.41 
 
 		 295 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000101161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0542  hypothetical protein  38.33 
 
 		 236 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3596  hypothetical protein  39.39 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3413  general secretion pathway protein H  27.97 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1880 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0882  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0129  hypothetical protein  43.75 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1351  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0084  methylation  27.14 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  34.93 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2706  ankyrin  26.98 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1350  hypothetical protein  31.09 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 2885 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3595  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3525  hypothetical protein  26.13 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.634437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0121  hypothetical protein  25.2 
 
 		 240 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1035 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  34.43 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1525  rhizobiocin/RTX toxin  30.77 
 
 		 301 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  29.07 
 
 		 353 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>