35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1341 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1341  GTP-sensing pleiotropic transcriptional repressor CodY  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000508255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07580  transcriptional repressor CodY  49.03 
 
 
260 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1031  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000437393  unclonable  0.0000000093058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1386  transcriptional repressor CodY  53.15 
 
 
261 aa  241  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062677  normal  0.893187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1955  transcriptional repressor CodY  48.63 
 
 
258 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00079706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1673  transcriptional repressor CodY  48.63 
 
 
258 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000117412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1228  transcriptional repressor CodY  50.39 
 
 
261 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000144432  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3711  transcriptional repressor CodY  47.47 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1697  transcriptional repressor CodY  51.18 
 
 
250 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00224201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1979  transcriptional repressor CodY  48.25 
 
 
261 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000233439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1999  transcriptional repressor CodY  50.78 
 
 
259 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1107  transcriptional repressor CodY  50 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1317  transcriptional repressor CodY  49.42 
 
 
259 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000604524  hitchhiker  6.27624e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3926  transcriptional repressor CodY  49.42 
 
 
259 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000252017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3869  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3840  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.06585e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3875  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000053796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3679  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000500442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3569  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.9638199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3587  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000152873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3966  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000207979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2480  transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
259 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000457374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0605  transcriptional repressor CodY  48.62 
 
 
259 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3651  transcriptional repressor CodY  48.63 
 
 
259 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1340  transcriptional repressor CodY  45.45 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000548296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1315  transcriptional repressor CodY  45.45 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000018867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0821  transcriptional repressor CodY  45.45 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0845  transcriptional repressor CodY  43.02 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2378  transcriptional repressor CodY  37.74 
 
 
262 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000594267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1675  transcriptional repressor CodY  39.3 
 
 
261 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1599  transcriptional repressor CodY  38.91 
 
 
261 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00104108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2721  transcriptional repressor CodY  37.7 
 
 
255 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000105427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2177  transcriptional repressor CodY  37.69 
 
 
264 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.494459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  37.02 
 
 
262 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000303115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1982  pleiotropic transcriptional repressor  26.96 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>