24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1832 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1832  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0246453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1795  radical SAM domain-containing protein  96.51 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1582  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1664  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 		 254 aa  118  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1824  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0456  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1610  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.1 
 
 		 514 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 514 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 414 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 514 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0516  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.4 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0252566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.23 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.79 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.51 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>