77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1314 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  97.1 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  60.27 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  41.25 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  47.95 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  45.59 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  40.79 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  40.3 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  32.43 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  36 
 
 		 666 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0843  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.59 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0194425  normal  0.0837964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.53 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1172  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.71 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.95 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.57 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.49 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.49 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.26 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  29.17 
 
 		 653 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  29.87 
 
 		 645 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 		 562 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  28.95 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.06 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.67 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  29.87 
 
 		 645 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.75 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.32 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.67 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0029  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1719  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.21 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.71494  normal  0.464231 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  31.88 
 
 		 667 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2081  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.38 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.410496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1369  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1317  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0108  hypothetical protein  27.63 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.996331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0702  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.27 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0147  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.87 
 
 		 677 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  35.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01790  NADH dehydrogenase I subunit E  27.71 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  31.51 
 
 		 666 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  25.97 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0428  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  21.52 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  27.03 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0863  hydrogenase subunit HymA, putative  29.73 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0781  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.73 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1858  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_766  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit F subfamily  29.73 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1247  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.49 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0560002  normal  0.0336661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  26.32 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 569 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  34.33 
 
 		 659 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  37.33 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000048911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.95 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0660  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  26.67 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  25.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  24.68 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  24.68 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.38 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0913  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  28.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  28.38 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  32.05 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  24.68 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  27.03 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  25.33 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0995  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.61 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.41379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1846  NADP-reducing hydrogenase chain A  26.32 
 
 		 168 aa  40  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  24.05 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  31.33 
 
 		 641 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>