26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3187 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 196 aa  411  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1669  hypothetical protein  45.88 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2660  metal-dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2676  metal-dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560092  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2631  metal-dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  48.82 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1476  hypothetical protein  45.81 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288269  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3130  hypothetical protein  44.69 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0593559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2610  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.0160149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  44.9 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  42.61 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  41.81 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1210  metal-dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  28.19 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  31.76 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  46.81 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0865  hypothetical protein  36.07 
 
 		 273 aa  44.7  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.90175  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  41.67 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  40.48 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>