More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2190 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2190  aldo/keto reductase  100 
 
 		 348 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.888803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2823  aldo/keto reductase  64.29 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3142  aldo/keto reductase  60.97 
 
 		 374 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  57.47 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  54.6 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1198  aldo/keto reductase  54.18 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2079  aldo/keto reductase  55.71 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.042571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0423  aldo/keto reductase  54.86 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  53.74 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2347  aldo/keto reductase  55.46 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2824  aldo/keto reductase  55.81 
 
 		 409 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  49.42 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  47.99 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  45.43 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  47.58 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  47.01 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  44.73 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.16 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  45.53 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  43.63 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  44.94 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  45.3 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  44.44 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  43.75 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2350  aldo/keto reductase  45.01 
 
 		 350 aa  281  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.788552  normal  0.04673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  42.86 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  43.18 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  42.9 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  43.02 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  44.73 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  42.9 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  42.9 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  42.57 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  45.33 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  44.63 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  44.63 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  44.63 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  44.63 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  44.63 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  44.89 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  42.57 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  43.59 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  44.67 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.03 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  43.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  43.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  43.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  43.75 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  43.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  43.75 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  43.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  42.57 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00708  putative NADPH-dependent aldose reductase  41.88 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.791046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  43.18 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  43.43 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  42.9 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  42.61 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 352 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  41.41 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  40.85 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1076  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637292  normal  0.6452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  40.4 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3476  aldo/keto reductase  44.13 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.293205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1865  aldo/keto reductase  42 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000172357  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  40.28 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3262  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  40 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  40.28 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  40 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.11 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.06 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  40.34 
 
 		 345 aa  255  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  40 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  40 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  40.68 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  39.72 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  39.03 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  42.82 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4994  aldo/keto reductase  42.18 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3774  aldo/keto reductase  43.43 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1592  aldo/keto reductase  43.3 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>