47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1279 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  43.08 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  45 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  46.88 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  40 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  46.15 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  43.75 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  46.77 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  46.77 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  40.58 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  48.53 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  53.19 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  35.82 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  37.5 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  42.19 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  42.19 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  42.19 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  42.22 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  44.12 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  44.44 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  35.38 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  48.15 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0697  tail X family protein  40.58 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  40.91 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  36.92 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  35.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  32.84 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  41.67 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  38.89 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  40 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  42.42 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2507  phage tail X family protein  29.23 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4548  phage Tail Protein X  36.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.729897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4547  phage Tail Protein X  36.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.383344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4463  phage Tail Protein X  36.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  38.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2499  phage tail X family protein  29.23 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  44.78 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  44.78 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  37.5 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1394  putative bacteriophage protein  50 
 
 		 40 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0571  tail X family protein  49.02 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  34.38 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>