16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0904 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  100 
 
 		 311 aa  610  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  44.38 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  40.06 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  44.3 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  44.3 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  43.09 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  38.21 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  37.17 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  33.8 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  32.47 
 
 		 440 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.72 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  26.95 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.11 
 
 		 489 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>