13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2534 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  792    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  28.02 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  26.11 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  23.81 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  28.15 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  30.34 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  25.34 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  29.15 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  27.27 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  27.73 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  22.51 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35958  predicted protein  28.49 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  25.19 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>