36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0663 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  100 
 
 
118 aa  246  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  43.97 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  29.91 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  26.85 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  33.05 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  30.91 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  28 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  29.06 
 
 
117 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  20.51 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  30.84 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  27 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1263  hypothetical protein  34.44 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.597675  normal  0.0357091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  28.21 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  26.13 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  27.35 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  23 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  29.09 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  32.14 
 
 
118 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  22.22 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  23.28 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  22.88 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0698  DsrE family protein  28.85 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  24.58 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  25.23 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  23.73 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  23.96 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  30.38 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  26.17 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12481  hypothetical protein  26.44 
 
 
125 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0954316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  25.93 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  23.73 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  27.08 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  26.19 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  24.24 
 
 
272 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  28.42 
 
 
117 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.911258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>