18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2671 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1325    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1101  hypothetical protein  25.56 
 
 		 688 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2300  hypothetical protein  24.82 
 
 		 727 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5443  hypothetical protein  26.07 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3572  hypothetical protein  25.27 
 
 		 701 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.433976  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1249  hypothetical protein  23.64 
 
 		 629 aa  178  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.905075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3306  hypothetical protein  21.65 
 
 		 695 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3864  hypothetical protein  23.5 
 
 		 658 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0913567  normal  0.365834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3557  hypothetical protein  23.44 
 
 		 637 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  28.04 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  23.59 
 
 		 550 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  23.15 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  21.74 
 
 		 550 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  24.41 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  27.08 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  32.47 
 
 		 586 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  31.43 
 
 		 545 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  21.58 
 
 		 551 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>