46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2666 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2666  carbon-nitrogen family hydrolase  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1485  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2050  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.08 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1112  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.56 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1888  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
326 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.08 
 
 
543 aa  55.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2863  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.06 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00148753  hitchhiker  0.000000691247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  21.58 
 
 
552 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1286  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2371  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  19.92 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.41 
 
 
576 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.41 
 
 
576 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4379  N-carbamoylputrescine amidase  21.4 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.349196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2309  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.34 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  18.6 
 
 
567 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2760  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.32 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.95 
 
 
574 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1294  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.11 
 
 
500 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3093  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.51 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  22.61 
 
 
543 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  23.68 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  22.13 
 
 
554 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3422  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4889  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.32 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0602  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.526814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3483  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.2 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000994394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0276  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  20.5 
 
 
553 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1638  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  20.65 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00765583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48470  putative N-carbamoylputrescine amidohydrolase  20.62 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000172873  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  21.96 
 
 
570 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0833  N-carbamoylputrescine amidohydrolase  20.77 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3339  N-carbamoylputrescine amidohydrolase  20.77 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  23.18 
 
 
538 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2248  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.1 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  21.37 
 
 
557 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  17.67 
 
 
567 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0835  N-carbamoylputrescine amidase  20.77 
 
 
294 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  18.78 
 
 
554 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2229  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.92 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0031262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4696  N-carbamoylputrescine amidase  24.86 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.582983  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  18.78 
 
 
554 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  29.73 
 
 
565 aa  42  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.08 
 
 
264 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.97612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4624  N-carbamoylputrescine amidase  19.05 
 
 
298 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2352  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.31 
 
 
286 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>