23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2159 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0907  hypothetical protein  33.85 
 
 
198 aa  105  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  31.96 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  29.7 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  25.37 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  20.5 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  27.45 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  26.11 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  30.05 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  29.06 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  26.9 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0313  hypothetical protein  29.5 
 
 
216 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  24.75 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  29.11 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  25.63 
 
 
215 aa  52  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  27.18 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2657  hypothetical protein  29.38 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.020977  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1435  hypothetical protein  30.36 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185215  normal  0.679893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  22.93 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  27.18 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  24.26 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00740  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  31.82 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.603366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>