13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2078 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  26.21 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 4079 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1005 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 1034 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.09 
 
 		 2145 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 468 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 955 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1550 aa  42.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>