299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1400 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  100 
 
 
650 aa  1326    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  39.08 
 
 
647 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  40.87 
 
 
645 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  39.73 
 
 
652 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  39.27 
 
 
642 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  41.11 
 
 
635 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.24 
 
 
635 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  38.64 
 
 
644 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  36.4 
 
 
647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  37.59 
 
 
676 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  34.21 
 
 
600 aa  333  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  33.24 
 
 
690 aa  333  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  33.53 
 
 
679 aa  332  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  33.38 
 
 
686 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  33.24 
 
 
690 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  33.24 
 
 
690 aa  328  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  32.89 
 
 
680 aa  328  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  31.57 
 
 
704 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  32.46 
 
 
689 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  33.09 
 
 
680 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  32.19 
 
 
682 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  32.85 
 
 
692 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  32.61 
 
 
691 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  33.09 
 
 
681 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  31.45 
 
 
680 aa  317  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  31.23 
 
 
681 aa  317  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  32.66 
 
 
678 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  32.65 
 
 
680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  32.65 
 
 
680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  32.65 
 
 
680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  31.9 
 
 
716 aa  313  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  31.86 
 
 
738 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  32.31 
 
 
683 aa  313  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  30.84 
 
 
686 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  31.23 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  32.12 
 
 
679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  31.69 
 
 
684 aa  308  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  31.46 
 
 
678 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  32.94 
 
 
685 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.47 
 
 
682 aa  303  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  31.82 
 
 
699 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  31.77 
 
 
687 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  31.84 
 
 
679 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  30 
 
 
802 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  39.35 
 
 
846 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.22 
 
 
583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  25.16 
 
 
573 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  22.12 
 
 
576 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.19 
 
 
566 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  21.99 
 
 
576 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  23.72 
 
 
566 aa  104  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.04 
 
 
566 aa  104  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  22.78 
 
 
599 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.41 
 
 
577 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  22.65 
 
 
587 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  29.82 
 
 
540 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  24.42 
 
 
545 aa  90.5  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  28.76 
 
 
561 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  28.76 
 
 
561 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  21.63 
 
 
545 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  31.4 
 
 
543 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  23.22 
 
 
553 aa  89.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  22.66 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  23.64 
 
 
542 aa  88.6  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  27.38 
 
 
560 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  23.92 
 
 
545 aa  87.4  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  24.7 
 
 
567 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1435  NAD+ synthetase  28.67 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0116683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.62 
 
 
556 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  23.47 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  28.12 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  23.02 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  27.67 
 
 
540 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.4 
 
 
577 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  23.53 
 
 
582 aa  83.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  27.67 
 
 
540 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  26.69 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  27.67 
 
 
540 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.7 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.42 
 
 
538 aa  82  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  22.1 
 
 
591 aa  82  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  30.87 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  25.48 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  28.05 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  28.05 
 
 
561 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  26.89 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  28.62 
 
 
565 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  23.56 
 
 
566 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  35.9 
 
 
567 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.4 
 
 
543 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.92 
 
 
545 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  23.05 
 
 
539 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  28.16 
 
 
586 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  29.59 
 
 
565 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0095  NAD+ synthetase  22.74 
 
 
630 aa  79  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0107801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  27.17 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  26.09 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0531  NAD+ synthetase  28.53 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.665741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0752  NAD+ synthetase  26.74 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.204171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  25.44 
 
 
552 aa  77  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>