26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12753 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  299  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  57.05 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  57.05 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  57.05 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  52.59 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2400  limonene-1,2-epoxide hydrolase  45.61 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  47.01 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  43.31 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3208  Limonene-12-epoxide hydrolase  43.12 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  37.12 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.29 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.48 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.5 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  31.5 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.5 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  32.76 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  35.96 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.95 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.56 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2783  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.03 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2797  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.03 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2753  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.03 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  28.06 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  24.04 
 
 		 124 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>