56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10871 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  64.38 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  64.38 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  64.38 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  61.64 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  61.64 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  61.64 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  61.64 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  60.27 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  56.55 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  56.55 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  56.55 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  41.78 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  39.29 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  41.1 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  39.44 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  37.9 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  37.76 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 153 aa  97.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  39.01 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  39.01 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  39.01 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  35.46 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  35.21 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 150 aa  84.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  26.06 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  22.22 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  21.8 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  24.32 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>