26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2102 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2102  NAD-reducing hydrogenase gamma  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.705334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  62.5 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  62.5 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3641  ferredoxin  60 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  58.75 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  58.75 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  55.13 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1260  hypothetical protein  38.36 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  43.06 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08351  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  39.47 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13281  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13531  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.430148  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0772  hypothetical protein  39.74 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16131  hypothetical protein  48.28 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  34.72 
 
 		 760 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.21 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3229  (2Fe-2S)-binding  39.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  36.14 
 
 		 609 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  41.33 
 
 		 353 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  43.48 
 
 		 336 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  33.8 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.3 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>