14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1647 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1647  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.559763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1101  hypothetical protein  36.96 
 
 
303 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  36.63 
 
 
303 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  30.28 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  24.55 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  31.16 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  33.79 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  28.99 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  28.92 
 
 
474 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.83 
 
 
216 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>