13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0514 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  60.16 
 
 
172 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  70.83 
 
 
164 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  62.38 
 
 
165 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  56.35 
 
 
162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  50.76 
 
 
173 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  50.76 
 
 
173 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  58.25 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  47.9 
 
 
128 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  48.94 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  39.77 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  36 
 
 
169 aa  40  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  36.25 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>