24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0364 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  60.61 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  54.44 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  53.85 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  54.6 
 
 
180 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  54.6 
 
 
180 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  32.26 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  29.59 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  26.92 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  27.33 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  30.32 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  28.75 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  25.95 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  26.92 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  22.29 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  23.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  24.68 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  23.9 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  25 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  20.39 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>