23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3366 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3366  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 361 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.424876  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3572  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like  50.71 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2390  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  43.87 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2234  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  44.18 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1074  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  29.91 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1208  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.139759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  22.78 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  23.51 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.31 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.56 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 419 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>