22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1958 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  54.43 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  51.92 
 
 		 163 aa  180  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.8 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  40.51 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  38.61 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  38.61 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  38.61 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  36.71 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  38.81 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  45.95 
 
 		 82 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  29.17 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  29.63 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>