44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1374 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1374  metallophosphoesterase  100 
 
 
374 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1269  metallophosphoesterase  64.53 
 
 
365 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1182  metallophosphoesterase  62.33 
 
 
372 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1157  metallophosphoesterase  62.75 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1086  metallophosphoesterase  63.06 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0953026  normal  0.926855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1152  metallophosphoesterase  62.76 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10308  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1086  metallophosphoesterase  58.73 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0406613  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3480  phosphatase  58.7 
 
 
384 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3168  metallophosphoesterase  59.95 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3167  metallophosphoesterase  59.14 
 
 
400 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3311  metallophosphoesterase  59.41 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589148  normal  0.0337729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1203  metallophosphoesterase  59.84 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00203569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1012  hypothetical protein  56.72 
 
 
346 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1191  metallophosphoesterase  41.86 
 
 
375 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.37211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3146  metallophosphoesterase  32.74 
 
 
358 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0975  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
849 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4610  metallophosphoesterase  26.35 
 
 
375 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3839  predicted protein  28.68 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00297256  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89674  predicted protein  25.48 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782489  normal  0.869116 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02150  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2170  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0118  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  hitchhiker  0.000000000439363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0293  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.73 
 
 
1457 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0903  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.73 
 
 
1457 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0270  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.73 
 
 
1457 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38815  predicted protein  26.3 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677964  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0978  hypothetical protein  23.64 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8809  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34100  Calcineurin-like phosphoesterase  29.37 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
274 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0050  metallophosphoesterase  21.58 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  25.52 
 
 
230 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  36.14 
 
 
223 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
230 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28347  predicted protein  27.62 
 
 
290 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0277321  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  28.67 
 
 
923 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  35.23 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  28.47 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  26.44 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  25 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
280 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  23.4 
 
 
334 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>