28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0101 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  64.65 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  61.11 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  63.93 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  63.93 
 
 		 211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  62.84 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  63.19 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  63.39 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  63.39 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  62.09 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  61.75 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  53.76 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  45.36 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  32.26 
 
 		 402 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  35.29 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  32.65 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  34.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  35 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 		 427 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  35.29 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  35.79 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1065  paraquat-inducible protein A  29.2 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  27.34 
 
 		 207 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  33.72 
 
 		 380 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  34.67 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  38.75 
 
 		 449 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>