More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1849 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  100 
 
 		 77 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  52 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  50.67 
 
 		 76 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  48 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  48 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  48.72 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  48.72 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  49.32 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  51.52 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  48.61 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  50.79 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>