15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2739 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 118 aa  227  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  42.73 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.73 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  42.2 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  34.82 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  35.06 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  32.73 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  40 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  37.7 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  37.7 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  30.34 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  32.35 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>