26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2397 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 581 aa  1178    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.57 
 
 		 562 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.14 
 
 		 565 aa  349  7e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.92 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  30.18 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  30 
 
 		 545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  29.52 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.7 
 
 		 552 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  27.17 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.14 
 
 		 577 aa  177  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.76 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.4 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.94 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.63 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.23 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.49 
 
 		 548 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.32 
 
 		 531 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.27 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.03 
 
 		 541 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.17 
 
 		 545 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.89 
 
 		 583 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  24.19 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.43 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  36.84 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.57 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  43.86 
 
 		 493 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.461915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>