24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0768 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  32.03 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  30.83 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  29.37 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.34 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  31.65 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.3 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  30.3 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.3 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  29.89 
 
 		 223 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  35.79 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.97 
 
 		 235 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  34.92 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>