More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
364 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  66.49 
 
 
365 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  54.31 
 
 
393 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  56.95 
 
 
362 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  56.6 
 
 
372 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2404  peptidase M24  58.38 
 
 
373 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2398  peptidase M24  58.38 
 
 
373 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.701554  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  56.23 
 
 
376 aa  346  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3753  peptidase M24  59.25 
 
 
360 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  55.41 
 
 
379 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2650  peptidase M24  58.09 
 
 
360 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  58.65 
 
 
370 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2357  peptidase M24  57.63 
 
 
352 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  53.3 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  52.03 
 
 
358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  51.83 
 
 
354 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  44.63 
 
 
357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  41.18 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  45.61 
 
 
357 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  40.17 
 
 
356 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  37.08 
 
 
356 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  43.37 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  37.82 
 
 
353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  37.82 
 
 
353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  48.03 
 
 
363 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  41.53 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  35.96 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  39.71 
 
 
353 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  40.06 
 
 
357 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  35.39 
 
 
356 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  35.96 
 
 
356 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  43.09 
 
 
367 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  40.62 
 
 
353 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  35.96 
 
 
356 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  35.96 
 
 
356 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  34.83 
 
 
356 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  35.39 
 
 
356 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  34.83 
 
 
356 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  39.66 
 
 
357 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  40.85 
 
 
353 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  37.74 
 
 
359 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  40.4 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  34.83 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  37.86 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  40.11 
 
 
353 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  39.94 
 
 
353 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  40.11 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  40.11 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  40.11 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  40.11 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  39.77 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  39.83 
 
 
353 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  40.4 
 
 
353 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  38.06 
 
 
352 aa  238  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  35.46 
 
 
353 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  38.14 
 
 
354 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  38.89 
 
 
362 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  40.94 
 
 
356 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  37.98 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  40.93 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  38.5 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  40.94 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  39.66 
 
 
369 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  38.66 
 
 
347 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  37.71 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  39.02 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  41.67 
 
 
356 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  36.57 
 
 
354 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  40.17 
 
 
361 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  35.25 
 
 
364 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  40.17 
 
 
347 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  36.91 
 
 
362 aa  222  9e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  37.46 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  37.25 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  43.98 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  34.62 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  37.6 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  34.34 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  41.57 
 
 
357 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  42.03 
 
 
396 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  37.29 
 
 
361 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  39.73 
 
 
381 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  41.46 
 
 
359 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  36.74 
 
 
361 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  36.06 
 
 
352 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  40.5 
 
 
355 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  36.74 
 
 
361 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  36.74 
 
 
361 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  39 
 
 
355 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  33.96 
 
 
365 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  36.19 
 
 
361 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  36.19 
 
 
361 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  36.46 
 
 
361 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.53 
 
 
353 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  36.46 
 
 
361 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  41.76 
 
 
348 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  33.52 
 
 
357 aa  205  8e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  36.89 
 
 
358 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  36.46 
 
 
361 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  37.6 
 
 
374 aa  204  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>