20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  634    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  48.23 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  40.74 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  32.62 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  32.37 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2149  hypothetical protein  34.55 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  30.57 
 
 		 156 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  30.57 
 
 		 156 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  30.57 
 
 		 156 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  33.6 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  34.9 
 
 		 143 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  30.6 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  32.28 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>