15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  34.39 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  32.2 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  28.02 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  29.44 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  30.92 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  26.4 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  29.32 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  32.21 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  26.88 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  26.97 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  25.39 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3482  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  28.24 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  26.54 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  26.72 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>