284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0050 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0050  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0051  tRNA-Phe  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0026  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.981393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0017  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0071  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0016  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPhe01  tRNA-Phe  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0020  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0022  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.45164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0023  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00944199  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0133  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.091812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0091  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0039  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000106148  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t079  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t081  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t091  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0020  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.963611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t030  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00416804  normal  0.0398749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0043  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000783978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0030  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000136397  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0032  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0111  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000403582  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t100  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000153181  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0093  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0087  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0224782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t028  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00444384  normal  0.0406037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0139  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457093  normal  0.0810294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0032  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.272295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0020  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000569791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0021  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000531965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0105  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000135806  normal  0.713625 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0108  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000869293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0045  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0085  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0384171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0100  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000189649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0102  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0039  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0051  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0053  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0124  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101919  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0052  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0054  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.743391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0124  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000733103  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0026  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0580747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0112  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0390211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0050  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00823452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0052  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00638125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0121  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000163841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0109  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000406559  normal  0.781689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0165  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.337836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>