More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1910 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 66 aa  140  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  73.85 
 
 		 66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  74.6 
 
 		 66 aa  110  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  68.18 
 
 		 66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  69.84 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 65 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 66 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 66 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  61.9 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 74 aa  92.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 75 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 72 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 73 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  50 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  50 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  52.31 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  45.31 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  46.27 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  49.25 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000168077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>