More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3693 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  100 
 
 		 371 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  92.92 
 
 		 375 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  62.86 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  57.07 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  56.57 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  59.42 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  58.76 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  56.19 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  56.2 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  55.33 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  53.45 
 
 		 409 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  56.15 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  55.65 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  53.18 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  54.91 
 
 		 389 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  47.38 
 
 		 422 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  55.32 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  47.55 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  45.11 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  46.23 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  45.98 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.98 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  48.84 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  48.58 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  47.63 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  48.11 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  45.98 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.73 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  49.22 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  46.27 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  46.75 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  54.01 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  46.4 
 
 		 401 aa  342  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  46.5 
 
 		 403 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  44.95 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  46.67 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  44.73 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  50.5 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.37 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  50.5 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  50.5 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.48 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  46.63 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  44.39 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.47 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  50.13 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  44.9 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.36 
 
 		 401 aa  335  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  44.56 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  45.85 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  45.76 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  44.47 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  43.83 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  45.64 
 
 		 401 aa  332  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  45.73 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  44.56 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  45.6 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  46.08 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  41.94 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  43.32 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  43.58 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  45.36 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  44.59 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  43.72 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  42.82 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  44.81 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  47.16 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  43.36 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.12 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.28 
 
 		 397 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  48.81 
 
 		 583 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  45.99 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  45.93 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0056  acetate kinase  44.3 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.614754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  43.64 
 
 		 417 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  44.7 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  49.33 
 
 		 386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  44.73 
 
 		 395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  44.7 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  41.16 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  43.44 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  44.99 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.04 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  42.25 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  44.99 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  44.99 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  44.99 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  43.11 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  42.93 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  43.26 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  40.87 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.13 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  41.37 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  43.29 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>