More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2721 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2721  condensation domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380255  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2097  condensation domain-containing protein  44.29 
 
 
445 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6976  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  42.14 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.18 
 
 
2350 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.73 
 
 
5953 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.38 
 
 
7712 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.34 
 
 
8646 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.33 
 
 
6889 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.11 
 
 
2370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.22 
 
 
9498 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.16 
 
 
7310 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.46 
 
 
4336 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.66 
 
 
13537 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  31.5 
 
 
3352 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  31.5 
 
 
3328 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  30.04 
 
 
1436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.5 
 
 
6006 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.5 
 
 
6081 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  29.62 
 
 
2125 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.63 
 
 
5929 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.19 
 
 
6072 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  28.38 
 
 
4383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 
2098 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.33 
 
 
1839 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  30.82 
 
 
2614 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27.31 
 
 
6676 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.82 
 
 
5926 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.03 
 
 
4502 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  32.83 
 
 
2201 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  29.4 
 
 
3018 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.19 
 
 
2581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.56 
 
 
7785 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  31.44 
 
 
1356 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  24.84 
 
 
3308 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 
6661 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
8914 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  29.93 
 
 
6403 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.4 
 
 
3498 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.41 
 
 
1876 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  30.39 
 
 
4090 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
8915 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 
1816 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  34.23 
 
 
6999 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  26.04 
 
 
4354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.09 
 
 
4531 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  28.41 
 
 
3230 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 
3247 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 
8211 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  28.57 
 
 
5372 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  26.97 
 
 
4336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  26.23 
 
 
3942 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
2845 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
1691 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  33.22 
 
 
2333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.91 
 
 
3235 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.91 
 
 
4882 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.83 
 
 
7168 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  28.35 
 
 
2628 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
3432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  28.57 
 
 
1142 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  32.84 
 
 
4290 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.09 
 
 
5738 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  30.3 
 
 
2448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  25.12 
 
 
1556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.03 
 
 
1829 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.33 
 
 
1833 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  25.23 
 
 
1569 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.28 
 
 
1500 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.37 
 
 
2571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  30.82 
 
 
1109 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.37 
 
 
2571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  31.42 
 
 
1114 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  27.83 
 
 
2187 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  27.81 
 
 
2012 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  29.35 
 
 
4196 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  24.46 
 
 
6404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  27.88 
 
 
4317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.63 
 
 
1806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.25 
 
 
5213 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  26.06 
 
 
6202 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.72 
 
 
3002 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  25.85 
 
 
2193 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  23.96 
 
 
7122 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  27.35 
 
 
1550 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  28.48 
 
 
2106 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  26.7 
 
 
3453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  25.72 
 
 
5654 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  24.83 
 
 
2151 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 
1137 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.13 
 
 
4489 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 
2419 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  27.7 
 
 
3180 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  33.13 
 
 
3710 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  27.99 
 
 
1914 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  25.81 
 
 
9175 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  28.31 
 
 
4317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  25.71 
 
 
1436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.85 
 
 
4747 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 
11233 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.71 
 
 
3432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>