25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2266 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  96.43 
 
 		 254 aa  470  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  78.6 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  76.95 
 
 		 251 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  68.53 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  47.37 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  44.92 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.21 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.44 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  43.22 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  47.28 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  47.28 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  46.86 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  46.03 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 730 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 734 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.68 
 
 		 745 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 733 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.75 
 
 		 732 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  31.97 
 
 		 146 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  31.76 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  31.39 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  31.97 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>