20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1616 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 757 aa  1548    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  41.43 
 
 		 702 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  34.47 
 
 		 574 aa  285  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  30.6 
 
 		 626 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  29.87 
 
 		 662 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  31.1 
 
 		 492 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  32.18 
 
 		 890 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.26 
 
 		 2668 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  27.81 
 
 		 683 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  30.58 
 
 		 489 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 318 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  27.11 
 
 		 447 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  24.43 
 
 		 649 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  26.22 
 
 		 2105 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  25.46 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1032  cell wall anchor domain-containing protein  70.45 
 
 		 398 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0114324  decreased coverage  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  25.79 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0444  YvnB  48 
 
 		 98 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>