20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1535 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  93.04 
 
 		 115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  82.61 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  79.83 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  82.88 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  79.83 
 
 		 119 aa  193  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  76.07 
 
 		 154 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  64.66 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  59.63 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  43.86 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  44.25 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  43.75 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  43.75 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  41.46 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  67.35 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  37.7 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  26.19 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  27.12 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  47.73 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>